Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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