Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gse1Q3U3C9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gse1Q3U3C9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms