Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud5Q3U2S4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud5Q3U2S4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms