Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm4dQ3U2K5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms