Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vars2Q3U2A8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vars2Q3U2A8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms