Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms