Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem88bQ3TYP4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem88bQ3TYP4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms