Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTL0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms