Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D17Wsu92eQ3TT38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
D17Wsu92eQ3TT38 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms