Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc4Q3TR08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms