Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afvQ3THW5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afvQ3THW5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms