Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDD9

Ppp1r21, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r21Q3TDD9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp1r21Q3TDD9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r21Q3TDD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms