Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VrtnQ3SYK4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VrtnQ3SYK4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms