Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms