Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms