Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms