Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1aQ2LKU9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms