Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam178bQ24JP3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam178bQ24JP3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms