Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cers3Q1A3B0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cers3Q1A3B0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cers3Q1A3B0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cers3Q1A3B0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cers3Q1A3B0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cers3Q1A3B0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
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