Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptcd3Q14C51 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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