Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli2Q0VGT2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms