Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b3Q0VF55 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms