Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms