Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms