Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn2bQ0KL01 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms