Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21bQ0HA38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc21bQ0HA38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms