Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf541Q0GGX2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms