Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncf1Q09014 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncf1Q09014 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncf1Q09014 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncf1Q09014 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncf1Q09014 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms