Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700061G19RikQ08EE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms