Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Col17a1Q07563 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms