Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdx4Q07424 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cdx4Q07424 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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