Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cntn3Q07409 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cntn3Q07409 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms