Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CluQ06890 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CluQ06890 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CluQ06890 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CluQ06890 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CluQ06890 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CluQ06890 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CluQ06890 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CluQ06890 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CluQ06890 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CluQ06890 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CluQ06890 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CluQ06890 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CluQ06890 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CluQ06890 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms