Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms