Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms