Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms