Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms