Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcad1Q04692 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms