Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms