Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PrkczQ02956 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkczQ02956 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms