Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb5Q02739 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb5Q02739 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms