Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Muc1Q02496 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Muc1Q02496 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms