Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JupQ02257 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JupQ02257 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JupQ02257 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JupQ02257 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JupQ02257 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JupQ02257 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JupQ02257 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JupQ02257 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JupQ02257 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JupQ02257 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JupQ02257 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms