Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VcpQ01853 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms