Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd1Q01822 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms