Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23aQ01405 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms