Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Top2aQ01320 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Top2aQ01320 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms