Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EgfrQ01279 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms