Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja5Q01231 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms