Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms